Yvon Chouinard, fondatore di Patagonia, fin dalla giovane età, è stato un grande appassionato di scalata . Da qui nacque l'interesse e la voglia di costruire una personale attrezzatura. L'attrezzatura di Chouinard nel tempo ebbe successo al punto che dovette iniziare a produrla a livello industriale.

Nel 1970 la Chouinard Equipment era diventata il maggior fornitore di attrezzatura per arrampicata e alpinismo degli Stati Uniti. Durante un tour d’arrampicata, Chouinard comprò una maglia di una squadra di rugby, pensando che fosse perfetta per arrampicare.  Era blu con due strisce rosse e una gialla sul petto. Una volta indossata tutti i suoi amici gli chiesero dove potevano trovarne una. Di li la richiesta fu sempre maggiore, per cui Chouinard decise di produrre anche abbigliamento ispirato a quella maglia, il nome della linea fu Patagonia, esotico, affascinante, un posto non ancora segnato sulle mappe, perfetto per descrivere l'azienda.

Patagonia è sempre stata impegnata nella lotta per la difesa dell'ambiente, sostenendo sempre svariati progetti sulla salvaguardia del pianeta.

L'azienda utilizza solo materiali rispettosi della natura, perlopiù cotone organico, ma anche capi formati da canapa e poliestere riciclato.